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地球细菌名单添了12000个“新人”!微生物种群多样性大增超四成

2020-11-10 17:18 前瞻网   

 

地球细菌名单添了12000个“新人”!微生物种群多样性大增超四成

近日,在地球细菌名单上又有超过12000种新的细菌和古菌被添加进来,这使得已知的微生物种群多样性增加了44%。

来自美国能源部联合基因组研究所和其他机构的研究人员致力于破译环境DNA样本,以识别单个物种。

这项工作包括检测来自海洋、土壤、动物和人类的52000份DNA样本,这些样本中含有混杂的细菌DNA。

研究小组能够从这些混杂的基因汤中提取并重建12000个单一物种的DNA,并将目前已知物种的多样性从27000个增加到将近40000个。

该研究小组表示,这一发现可能会导致在细菌中发现新的蛋白质,并在未来进一步研究中成为一种资源。

研究人员还能够识别出科学家迄今为止无法在实验室中培育的病毒的可能宿主细菌,这为新的治疗方法带来了希望。

52,515个样本的原始资源是迄今为止最大的努力,以捕获地球生物群落中细菌和古细菌基因组多样性的广度。

这项被称为GEM目录的工作“大大扩展了在世界各地发现的已知的细菌和古菌的多样性”。

然而,尽管已知细菌种类的数量激增,研究小组并没有发现任何新的深层分支或门——只是在现有的和已知的家族中发现的新物种。

生物群落样本包括海洋栖息地、沉积物、温泉、土壤、泥炭、洞穴、植物凋落物、人类、植物、真菌、哺乳动物、废水、实验室环境、建筑环境和固体废物等等。

根据研究小组的说法,尽管直接从环境中恢复的遗传物质增加了3.6倍——超过三分之二的仍然缺乏可映射的参考基因组——所以可能还有更多的物种存在。

尽管这些目录对许多新的候选物种来说是重要的占位符,但研究人员预计,未来许多目录将被更高质量的版本所取代,或最终被细胞克隆的基因组序列所取代。

“我们预计,GEM目录将成为未来新陈代谢和以基因组为中心的数据挖掘和实验验证的宝贵资源。”

像这样的大规模基因组清单,为更广泛的研究社区提供了关键的资源,因为细菌的基因组细节可以用于医学、一般科学研究和发现新蛋白质。

研究结果发表在《自然生物技术》杂志上。

编译/前瞻经济学人APP资讯组

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责任编辑: 3976DBC

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