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警惕!一种新的新冠变异株在墨西哥迅速蔓延,或可有效逃避免疫识别

前瞻网    2021-06-09 10:12

 

新冠病毒变异株频频出现,对疫情防控以及疫苗和药物疗效构成了新的威胁。一项发表于《医学病毒学杂志》(Journal of Medical Virology)的研究中,来自意大利博洛尼亚大学的科学家们又检测到了一种新型变异毒株。

据悉,该毒株在最近几周内一直在北美和欧洲传播,许多新病例集中在墨西哥。

警惕!一种新的新冠变异株在墨西哥迅速蔓延,或可有效逃避免疫识别

研究团队分析了截至2021年4月27日存放在GISAID公共数据库中的100多万条SARS-CoV-2基因组序列,并确定了一个位于SARS-CoV-2刺突蛋白上的新的T478K突变。该突变在结构上位于与人类受体ACE2的相互作用区域,在11,435个不同的病例中检测到。

该突变在结构上位于与人类受体ACE2的相互作用区域——冠状病毒附着在这个受体上感染细胞,从而更有效地实现传播感染。它还可以改变与免疫系统抗体的相互作用,从而阻碍药物的疗效。研究人员们发现,自2021年1月以来,T478K已经出现并出现频率上升,主要是在墨西哥和美国,但也可以在几个欧洲国家检测到它。

于2021年4月27日从GISAID数据库下载了所有公开获得的SARS-CoV-2基因组序列。结果获得了1,180571份样本,并标注了特征,如收集日期、来源地区、年龄和感染患者的性别。只有从人类宿主收集的病毒被保存起来进行进一步处理、筛减。

总的来说,截至2021年4月27日,他们在11,435名不同患者中检测到了T478K蛋白突变,是一个月前(2021年3月26日)观察到的数字(4214)的两倍多。约97%的突变(20205个样本)与穿山甲谱系的病毒变种B.1.1.519相关,其余的T478K突变事件在其他非来自B.1.1.519的谱系中分布较少,这支持了该突变在不同事件中不止一次出现的假设。

在B.1.214.3报告的85个样本中,有68个(80%)存在T478K蛋白突变;然而,这一谱系的病例总数很低,还没有使它成为一个值得关注的变体。

“这个变异株在北美的人群中日益蔓延,特别是在墨西哥。到目前为止,该变异株覆盖了这一地区现有病毒的50%以上,传播速度之快令人想起了最先在英国报告的变异毒株。”研究通讯作者、药学和生物技术系教授Federico Giorgi表示。

进一步的分析甚至表明,“墨西哥变异毒株”可能具有一种潜在的遗传途径,可以逃避免疫识别。据现有数据,T478K似乎在性别和年龄范围内均匀分布。在墨西哥,它占所有测序病毒的52.8%,占所有测序的美国样本的2.7%。在欧洲,研究人员表示T478K已经在德国、瑞士和瑞典“微弱地传播”。

译/前瞻经济学人APP资讯组

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